أحدث المجلس الملكي الاستشاري للشؤون الصحراوية لجانه الخمس المنصوص عليها في قانونه الداخلي ويتعلق الأمر باللجان التالية 

لجنة الشؤون الاجتماعية والتنمية البشرية والبيئة
 لجنة الشؤون الخارجية والتعاون
 لجنة الدفاع عن حقوق الإنسان والحريات العامة وسكان المخيمات
 لجنة الشؤون الاقتصادية والتربية والتكوين
 لجنة النهوض بالثقافة الحسانية والإعلام والتواصل